INTRODUCCIÓN A LA SIMULACIÓN MOLECULAR
TEMARIO
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Qué es Python
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Cómo se instala
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Programación básica
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Gráficas en Matplotlib
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Mecánica Newtoniana
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Ecuaciones de Movimiento
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Integración analítica y numérica de las ecuaciones de movimiento
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Solución numérica del tiro parabólico
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Relación entre Potencial y Fuerza
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Fuerzas de Dispersión
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Interacción electrostática
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Tratamiento de fuerzas de largo alcance
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Unidades Reducidas
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Costo Computacional
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Experimentos y Mediciones
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Cálculo de energía
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Cálculo de la Capacidad Calorífica
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Temperatura en la simulación molecular
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Grados de libertad
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Distribución de Velocidades
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Distribución de Maxwell-Boltzmann
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Cálculo de la presión
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Detalles del ensamble Microcanónico
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Bases de la termodinámica estadística
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Algoritmos Monte Carlo
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Acercándonos al equilibrio
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Fluctuaciones y número de átomos
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Análisis de una Dinámica Molecular
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La simulación molecular utilizando la paquetería GROMACS